五味子为木质藤本植物,其茎细长、柔软,需依附其他物体缠绕向上生长。地上部分的茎,从形态上可分为主干、主蔓、侧蔓、结果母枝和新梢,新梢又可分为结果枝和营养枝,。
从地面发出的树干称为主干,主蔓是主干的分枝,侧蔓是主蔓的分枝。结果母枝着生于主蔓或侧蔓上,为上一年成熟的新梢。从结果母枝上的芽眼所抽生的新梢,带有果穗的称为结果枝,不带果穗的称为营养枝。从植株基部或地下横走茎萌发的枝条称为萌蘖枝或基生枝。
五味子的茎较细弱,当新梢较短时常直立生长不缠绕,但当长至60~70厘米时,要依附其他树木或支架按顺时针方向缠绕向上生长,否则先端生长势变弱,生长点脱落,停止生长。新梢生长到秋季落叶后至次年萌芽之前称为1年生枝,根据1年生枝的长度可将其分为叶丛枝(5厘米以下)、短枝(5·l~10厘米)、中枝(10.1~25厘米)、长枝(25.)厘米以上)。
五味子的地下横走茎成熟时为棕褐色,前端幼嫩部位白色,生长点部位呈钩状弯曲,以利于排开土壤阻力向前伸展。茎上着生不定根,并可见已退化的叶,叶腋处着生腋芽。横走茎先端的芽较易萌发,萌发的芽中,前部多形成水平生长的横走茎,向四周延伸,后部的芽抽生萌蘖枝。萌蘖枝当年生长高度可达2~4米。在自然条件下,地下横走茎在地表以下5~15厘米深的土层内水平生长,是进行无性繁殖的主要器官。在人工栽培条件下,横走茎既有有用的一面,也有不利的一面。一方面可以利用其抽生萌蘖枝的特性,选留预备枝,对衰弱的主蔓进行更新;另一方面,又必须把不需要的萌蘖枝及时铲除掉,以免与母体争夺养分。